“都是姐姐害得了，你看，我们现在迷路了啦！”这一天，小智一行人不知道走到了什么地方的森林之中，这时小胜对小遥抱怨说。
“为什么说是我害的”，而小遥则是不同意的反驳说。
“我说那条路应该往右走，姐姐却是要往左走，才会变成这样的。”小胜继续抱怨着。
“可是那个时候看起来走这边比较有趣吗，而且路旁还开了好多可爱的花，况且拿着神奇宝贝领航员的人是你，你没有好好的带路，那怎么行呢？”小遥也继续辩解的说。
“那是因为我们在讯号外面，就是你害得”，小胜也毫不退让。
“好了，不要吵了，迷路是正常的事，我们以前也是经常的迷路的，迷的路比走的正确路还要多。”小智捂住了他们的嘴说道，两姐弟吵起来没完没了，还是早点调节好，说起迷路自己也有点不好意思，虽然他不是路痴，但他很喜欢迷路，迷路也是旅行重要的一部分。
“哼~”不过效果不怎么样，他们谁也不理谁。
拉迪亚斯觉得姐弟感情很好，以前她和哥哥也有这样的情况，不过很快又和好了，兄弟姐妹的感情都是这样，吵吵合合。
这时一群身影从前面树林闪过，小智马上开启波导，突然激动起来…
“看，是木守宫”，小智顺着看向前方的大树，看到好多的木守宫，非常的高兴，未来打败噩梦神的超级蜥蜴王就在里面。
“真的耶！”小胜看到木守宫，立刻高兴的说道。
“哇，好多的木守宫啊”，小遥也激动的说。
“这里一定是木守宫的森林。”小胜这时猜测说。
“我们追过去看看吧！”小智说完就先向前跑去。
“真是的，小智，等等我们啊！”，随后小遥他们也追了上来。
“哇，好大的树啊！”在追赶着木守宫跑了一段路程后,小智来到了一棵参天大树下感慨的说。
“你来了…”一道声音突然进了小智的脑袋里，小智一愣，左顾右盼的大声喊道“谁…到底叫我！”小智不由自主的向前走。
这时突然一根树枝插在了小智面前的地上，抬起头后，就看到树上一只木守宫手里还拿着一根树枝。
“木守宫，我要收服你，皮卡丘，你上吧。”小智终于找到了自己的木守宫，于是立刻派出了皮卡丘来应战，以后木守宫就由皮卡丘带着好了，而木守宫也知道了小智的意图，开始在树上快速的跳跃，在寻找向下攻击的最好时刻。
“很快，我喜欢，皮卡丘，铁尾。”木守宫终于下来了，并且尾巴使出拍击对着皮卡丘打了过来，皮卡丘也用尾巴攻击，铁尾比拍击威力强多了，木守宫反而被弹开，木守宫在空中稍微调整了一下后停在了树枝上，随后再次快速的冲了下来，而后木守宫再一次使用拍击，这次速度更加快了。
“避开！十万伏特。”皮卡丘向后一跳躲开了木守宫的攻击，在木守宫停顿的时候使用十万伏特打中木守宫。木守宫没有倒下，反而坚强的站起来。
“越是有骨气的我越喜欢，皮卡丘电磁波。”小智看到意志坚强的木守宫更加欢喜，不过对方也一定是强行撑着，不能再受到攻击了。
“去吧，神奇宝贝球。”将木守宫麻痹后，小智这个时候也扔出来宝贝球，“我收服木守宫了”，成功的收服了木守宫。
“出来吧，木守宫。”随后小智又把木守宫放了出来，给木守宫治疗，因为小智知道木守宫和这棵大树有很深的羁绊，因为它是在这颗大树上出生的，所以现在想要保护这颗树，所以必须把这件事情解决，而且他还想寻找一下刚刚的声音是怎么回事。
“就在小智把木守宫放出了之后，来了好多的木守宫，其中的一只年老的木守宫和小智的木守宫在说着，小智知道年老的是在劝解木守宫，毕竟这棵树枯成这样了，已经没什么一样了。
“小智，你在哪里？”这时候小遥他们的声音传了过来。
“我在这里！”小智大声喊道，对着她们挥了挥手，小遥她们马上跑了下来，其它木守宫们看到有很多人来，都四散离开了。
“你们看，这是我刚刚收服的木守宫。”小智介绍身边的木守宫。
“小智，你真的好狡猾，那么快就新神奇宝贝，我还是只有一只火稚鸡。”小遥抱怨到。
“旅行才刚刚开始，不用那么着急。”小智说到，“我们今天就在这里休息吧！”
“太好了，小刚，吃饭！”小遥高兴的说到，他已经被小刚的手艺牢牢的套住了。
“好的，拉迪亚斯，来帮忙吧！”小刚和拉迪亚斯开始准备食物，而小智带着木守宫离开了。
“木守宫，我来帮你吧！”小智对木守宫说道。
“跟我来！”木守宫对小智勾了勾手，小智跟着木守宫来到了小溪旁，小智和木守宫用树叶取水，然后走回大树那里，把水倒到水根处，在用树叶盖上，保持水分，这样一干就是很长时间。
“小智，可以吃饭了！”小遥对着还在忙的小智说道。
“来了！”小智放下树叶，找放出神奇宝贝让它们先吃饭，检查身体情况，然后再自己吃饭。
“小智还真是关心神奇宝贝。”小胜看着忙了很长时间，还要照顾神奇宝贝。
“小智就是这样！他非常喜欢神奇宝贝，他的神奇宝贝也喜欢他。”小刚说到。
这时森林里传来震耳欲聋的声音，小智他们马上跑过去看看，一个机器开始敲四周的大树，好多的木守宫从树上掉了下来，被机器抓走了，小智看到是火箭队。
“…………（火箭队经典台词）”。
“这些木守宫，我们要全部带走了。”武藏这时高兴的说道。
“火箭队，快把木守宫们放下来。”小智看到。
“那是不可能的！”
“既然这样，木守宫，上吧。”木守宫对着气球吐出树枝，但树枝没有刺破火箭队的气球，被弹了回来。
“哈哈哈，这种攻击对我们的气球是没有的，去吧，沙漠奈亚”，小次郎派出了神奇宝贝，沙漠奈亚一出来就抱着小次郎，身上的尖刺刺的小次郎哇哇叫。。
“是火箭队新的神奇宝贝。”小刚看到沙漠奈亚后惊讶的说。
“这就是沙漠奈亚啊。”小遥和小胜也在一边看着。
“沙漠奈亚，使用飞弹针”，
“木守宫，使用拍击”，
沙漠奈亚手臂上的针刺发出亮光，根根针刺发射而出，不过木守宫挥动着尾巴，把它们一一击落了下来。
“木守宫，电光一闪，冲啊！”看到木守宫已经跃上了树枝的最高处，小智对着木守宫喊道，然后就见木守宫一个加速，直接跳到了火箭队的气球上。
“啊”，武藏直接被木守宫给拍击到了，做到了一个按钮上，热气球下面关着木守宫们的笼子因此打开了，不过火箭队正在被木守宫给戏弄着，完全的没发现，随后木守宫跳到了气球上，挑拨沙漠奈亚，沙漠奈亚看到后非常的气愤，飞弹针再次使出。
结果气球被打破了，火箭队飞走了。
“好讨厌的感觉！”
“你，没事吧”，小智则是在下方稳稳的接住了木守宫。
木守宫摇摇头表示自己没有问题，木守宫的行为得到了木守宫们的认同，之前那些一开始来劝道木守宫的木守宫们也来帮小智他们取水，浇灌干枯的巨树。
可是就在大家忙碌了一晚上，清晨第一缕阳光洒下的时候，突然干枯的巨木中央从底部开始出现裂痕，木守宫看到后，一下就僵硬在了那里，太阳慢慢升起，阳光普洒而来。
出现在大家面前的是，荒芜的土地上，一粒种子破壳而出，饮朝露，浴日光，慢慢成长，春去秋来，风雨散去，微风吹来，郁郁葱葱，茎秆粗壮，枝叶繁茂，繁花开尽，播下粒粒嫩种，年复一年，森林随之而来。
“我的孩子就拜托你了！”这时候声音又传进了小智的耳朵，小智一愣，不可思议的看着这棵树，它居然有了自己的思维。
“这时这颗树的一生，而且原来这整座的森林都是从这棵树来的啊！”看到眼前的景象，小刚惊讶的说。
太阳完全升起后，干枯的巨树也最终成为了两半，轰到在地，不知从哪里飞出了两样东西，朝着小智飞过来，小智伸手一接，发现这是一颗种子和mega蜥蜴王进化石，这棵树怎么会有这种东西…
“木守宫，不要伤心了，整片森林都是这棵树的新生，而这颗种子，我想是这棵树感谢你对它的支持”，小智将种子递给眼含泪水的木守宫，“将它种在这附近吧，大树会埋于土地，成为它的养料，借此让它重生在这个世界的。”小智说到。
木守宫接过种子，随后把它埋在了地下，小智也随后拿来水帮它浇灌，希望它能像以前那样快速成长。
“我们走吧！”小智抱着木守宫离开了，在走出森林的那一刻，小智回头看了看那个地方，虽说万物都有灵，但他还是第一次看到树也有自己的灵，这让他对这个世界有了全新的认识。
小智看着手里的mega进化石，此时的他心中又多了一些疑问，为什么连树都知道自己…