第二章：动荡的世界
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PLANT的能量生产部门遭到BlueCosmos（蓝波斯菊）的恐怖袭击。评议委员对理事会要求暂时地停止输出，理事国方面加以拒绝。PLANT遭到严重的能源危机。
为了反对理事国的做法，PLANT内的技术者同时罢工。对此，理事国以舰队对PLANT进行威吓。PLANT内部开始高唱独立论。
以氏格尔?克莱恩与帕特利葛?萨拉这两位评议会议员为首，以从理事国独立出来为目标的政党集结，浮上台面活动，开始研究MobileSuit（MS）的军事专用研究。
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MobileSuit试作一号机的设计极秘密地开始。“黄道同盟”的活动活跃化，与扩大之新政党结合，变更名称为“自由条约黄道同盟(ZodiacAllianceofFreedomTreaty)”：简称为ZAFT(扎夫特)。
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MobileSuit实用一号机“Ginn（金恩）”完成，对Maius（5月）市的一部分进行极秘密的改造，开始增产MobileSuit。
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氏格尔?克莱恩被选为PLANT评议会议长。
ZAFT所属议员占评议会的多数，通过了“获得自治权与贸易自主权”作为最优先考虑的决议。隔月，于理事会所属的PLANT营运会议内表明此决议。
理事国大反弹。派出以武力为基础的示威行动，PLANT方面亦扩张军备对应，彼此反目。
BlueCosmos（蓝波斯菊）强大化，包括“自称”是基础阶层在内，据说共有数十万人之规模势力，对住在地球的调整者迫害激烈化。为此，调整者几乎移民至PLANT。
氏格尔?克莱恩议长，极秘密地与南美合众国以及大洋洲连合缔结契约，就PLANT与两国间达成食物输入以及工业输出协议。
这个动作立刻为理事国获知，理事国方面，由理事会解任氏格尔?克莱恩议长，并宣告解散议会，命令完全放弃PLANT的自治权。
PLANT方面就此感到反弹。就食物输出遭到限制，同时从南美输入食物的PLANT籍货物船团遭到击沉（曼德尔布罗特号事件）因此造成数百名调整者牺牲，紧张感一口气升到最高。
以“Mandelbort号事件（曼德尔布罗特号事故）”为契机，政治性社团“ZAFT”由帕特利葛?萨拉指导下解体、再编成，并与PLANT内的警察保安组织合并，组成为装备着MobileSuit（MS）的军事组织“ZAFT”。
L4的殖民卫星Mendel（孟德尔）发生生化事故，造成许多人死亡。该殖民卫星遭到放弃，大量放射伽玛射线以进行消毒。传闻这是BlueCosmos（蓝波斯菊）相当活跃的地下活动。GARMR&D破产，Mendel（孟德尔）之后就成为无人状态。
萨拉议员，将阿斯兰从Copernicus叫回来。虽然阿斯兰对彼此表明身为调整者的基拉建议一起回到PLANT，但是基拉选择留在Copernicus（哥白尼）。发誓有一天再会后，两人彼此分开。（各为13岁）。
大和夫妇鉴于情势恶化，因此带着基拉离开Copernicus（哥白尼），迁移到资源卫星Heliopolis（海利欧波利斯）。
同年，乔治?布莱德晋升为上校，科奇?塞维尼被秘密地特招为名誉少校，尽管是看似非正式的任命，但其军籍，军衔上确实为少校，年仅十三岁的少校在当时少数知道的中层官员中引起轩然大波。
“这就是妥协内容之一吗？”看着联合的少校任命书，科奇不禁想到。银白色头发头发下是怎样的一双紫色的眼睛。
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曾经世界有三个先进的科研机构，排在首位的就是阿兹拉艾尔财团下的研究所，其次就是奥布政府五大家族扶持的曙光社其中最主要的是萨哈克家族，最后就是巴比亚财团旗下的研究所，当调整者还在为联合输入高新科技产品时，地球的三大机构地位动摇，后来巴比亚财团的掌控者克里?塞维尼遇害，巴比亚财团在稳定一段时间后莫名被收购。
数年前，爷爷给的录像透露了部分势力对巴比亚虎视眈眈的原因——巴比亚财团没有调整者与自然人的区分，因此在早期研究与创造上取得了突破，例如新能源设施——微粒子太阳能板，核能聚变科技等。然而也因此被盯上，最后疯博士决定将巴比亚财团分割，一部分交由地球联合军军部，一部分交由东亚共和国，并共享核能聚变技术，条件是给予巴比亚财团残余势力的保护与支持，并给科奇?塞维尼，乔治?布莱德适当的军衔提升作为弥补，另外研究所雪藏于东亚共和国的一座太平洋某岛上，研究所每年为东亚共和国提供一些必要的有关军械的技术支持。
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氏格尔?克莱恩开始进行在PLANT内的粮食生产，并且将Junius市的第7～10区改建成生产谷物的PLANT。
理事国发现粮食生产一事，发出劝告说，即使要动用理事国的权力也要对此事加以排除，实际上采取威吓行动。此时，军事组织“ZAFT”与MobileSuit“Ginn”的存在首次公开，MobileSuit部队进行首次的军事行动，以少数目压倒性地歼灭了地球的MobileArmor部队。成功地排除了在宇宙区域中驻留的理事国宇宙军。
大西洋连邦宇宙军第4舰队（之后为地球连合军第八舰队）的哈尔巴顿准将洞察出在宇宙战斗中MobileSuit的有用性，向军司令部就开发代号为“G系列”一事提出申请，却遭到否决。然而这获得一部分议员的协助，此计划极秘密地进行。
智将哈尔巴顿的下属——著名技师黄炎龙（出自高达之究极技师）以及萨哈克家族旗下的曙光社研究员以及旧巴比亚财团研究所的齐德龙等研究员共同参与。
氏格尔?克莱恩议长，向理事国方面要求获得完全自治权以及对等贸易。
9/1，基拉?大和进入Heliopolis（海利欧波利斯）的工业学院就读。
虽然在PLANT理事会双方多次交涉，但是均未获得任何共识。PLANT方面明确表示，若至70年1月1日未获得回应，其将停止向地球输出资源。
理事国与PLANT之间的关系紧张激烈化。
未完待续